Chaetomorpha es especialmente común en acuarios de agua salada, ya que puede ser utilizado para la eliminación de nutrientes, especialmente nitratos. Los acuaristas comúnmente albergan esta alga, tal vez con otras, en un refugio . Chaetomorpha es preferible a otras macroalgas como Caulerpa porque tiene menos probabilidades que Caulerpa para someterse a la reproducción sexual en el acuario. También es fácil de eliminar porque no se va a adjuntar a las rocas o sustratos. En un estudio dirigido por Casey Campbell, se demostró que el lecho de carbón metano se filtra por Chaetomorpha. Además de la extracción de nutrientes, Chaetomorpha es conocida por albergar beneficiosos anfípodos que posteriormente pueden ser utilizados como una fuente de alimento para los corales y animales que pueden residir dentro del acuario.